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Utiliser le logiciel Rastop pour
localiser la zone de fixation de l'antigène par l'anticorps :
Ø Télécharger un fragment de la molécule d'anticorps liée à un antigène (clic droit puis "enregistrer la cible sous", enregistrer la molécule sur votre bureau ou dans vos documents)
Ø Ouvrir la molécule téléchargée avec le logiciel Rastop. (cf fiche technique). Le fichier comprend :
- l'extrémité d'une chaîne légère et d'une chaîne
lourde d'un anticorps (extrémité de l'un des bras court du Y)
- la molécule d'antigène (fixée à l'anticorps) Ø Faire Atomes Colorer par Chaine pour colorer différemment les 2 chaînes de l’anticorps et l’antigène
Ø Utiliser
la commande "abc"
pour afficher et/ou colorer les parties variables
des 2 chaînes
Rq : la commande "abc" vous permet de sélectionner les acides aminés souhaités et la palette de couleur vous permet de les colorer.
Ø Utiliser la touche "front" pour réaliser une coupe et montrer la complémentarité de forme entre l'antigène et l'anticorps (appuyer sur front puis maintenir la petite flèche de droite enfoncée jusqu'à ce que vous obteniez la coupe souhaitée. Vous pouvez revenir en arrière en utilisant la flèche de gauche)
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