Action des enzymes sur leur substrat

 

1. 

Les enzymes telles que le lysosyme permettent que les réactions biochimiques du vivant qui se feraient ordinairement en un temps très long en l'absence de catalyseur, soient considérablement accélérées. 

A titre d'exemple, une réaction qui met une seconde en présence d'une enzyme mettrait 12 jours en son absence, soit une accélération d'une facteur un million.
lysosyme sans son substrat ; remarquer la cavité dans la molécule en haut et à droite ...
... c'est dans cette cavité que vient se loger le substrat ; l'action chimique de l'enzyme peut alors débuter

2.

Une animation de l'action de l'enzyme sur son substrat

La réaction enzymatique se fait en 4 phases :
  1. le substrat se positionne dans la cavité
  2. l'enzyme le fixe
  3. la réaction se fait
  4. le substrat est transformé en produit(s), relâché(s) dans le milieu.

En 4 images ...

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Pour aller plus loin ...

Mécanisme d'action de l'enzyme sur son substrat : formation d'un acide carboxylique à partir d'une fonction amide

Dans le site fonctionnel de l'enzyme, 3 acides aminés jouent un rôle important dans la réaction ; repérer ces 3 acides aminés (le nombre indique leur position dans la chaîne polypeptidique) :
  • SER (sérine) 195
  • HIS (histidine)  57
  • ASP (acide aspartique) 102.
Le substrat (l'amide) arrive dans le site réactionnel de l'enzyme où il va venir se stabiliser par liaisons hydrogènes. La fonction alcool de la sérine va alors estérifier l'amide. Une molécule d'eau va ensuite hydrolyser l'ester formé entre l'amide initial et la serine de l'enzyme. Un acide carboxylique est libéré.

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