Modélisation de la structure tridimensionnelle de l’amylase
fixée sur un fragment d’amidon à l’aide du logiciel Rastop
1.Ouvrez
le fichier « amylase substrat
long ok. pdb ».
2.
3.
3. Choisissez
la représentation en sphères sans les liaisons hydrogènes et colorez
par chaîne.
La
chaine protéique A apparait bleue, vous pouvez alors
observer la localisation du fragment d'amidon représenté
par des couleurs différentes (rouge, gris et vert)
5.
5.Sélectionnez
les chaines F et D ( fragment d’amidon ramifiée) puis choisir
la même couleur pour les deux chaînes.
Faites une coupe
(mise en évidence de la complémentarité de forme de l'enzyme avec
son substrat).
