Dossier I activité 4

Les acides nucléiques (ADN et ARN) dans la relation noyau - cytoplasme

Problématique

Il a été vu précédemment d’une part, que le noyau est le siège de l’information génétique et que le support de celle-ci est une molécule, l’ADN (Acide Désoxyribo Nucléique), et d’autre part, que les protéines, responsables du phénotype moléculaire, sont synthétisées dans le cytoplasme. On connaît par ailleurs des molécules, les ARN (Acides Ribo Nucléiques) proches du point de vue de leur composition chimique, de l’ADN . La question qui se pose est alors :

 

Quelles sont les similitudes et les différences entre les deux types d’acides nucléiques (ADN / ARN) et par ailleurs quelles sont les relations moléculaires entre le noyau (siège de l’information génétique) et le cytoplasme (lieu de synthèse des protéines) ?

Objectifs

[ Saisir des informations (des observations microscopiques, du manuel, des visionneuses de molécules ou du site internet)

[ Manipuler (réaliser une préparation microscopique)

[ Utiliser des techniques d’observation (observation microscopique)

[ Maîtriser l’outil informatique (visionneuse de molécules « Rastop » ou « Molusc » )

[ Comprendre la relation ADN et ARNm 

Production attendue

[  un schéma  fonctionnel annoté présenté sur une double page en format paysage pour répondre à la problématique.  

 ==> supports  n°1 à n°10.

 

 

Critères de réussite

l la préparation microscopique est réalisée avec soin (temps de coloration et de rinçage sont respectés),

l  le schéma annoté présente ou explique :

[   l’observation microscopique réalisée à partir de la préparation microscopique, 

[   les caractéristiques structurales de l’ADN et de l’ARNm,

[   leur relation entre noyau et cytoplasme,

[   la synthèse (= transcription) de l’ARNm.

 

Conseils de réalisation

l  réaliser la préparation microscopique (respecter les temps de coloration et de rinçage),  l’observation microscopique puis visualiser les diverses molécules (secours).

l  comparer les molécules ADN et ARNm : le nombre de chaînes (= brins), la présence ou non de liaisons hydrogènes, le nom des nucléotides, le nom des acides nucléique (nature du sucre pentose), la localisation cellulaire (noyau et/ou cytoplasme).

l  faire figurer dans le schéma :  le contenu du noyau, ses caractéristiques cytologiques, le mouvement de l’ARNm, les principales étapes de la formation de l’ARNm en insistant sur tous les acteurs de la transcription.           

l  dans les annotations du schéma évoquer la durée de vie de la molécule ARNm et sa fonction (relation ARNm / protéines).   

Supports

1 :  Manipulation : protocole de coloration des acides nucléiques (ADN et ARN) par le vert de méthyle-pyronine

Le vert de méthyle colore l’ADN en vert et la pyronine colore les ARN en rose. (attention : ce colorant est à manipuler avec précaution et ne doit pas être jeté dans l’évier)

[   verser quelques mL du colorant dans un verre de montre et y déposer un petit fragment de l’épiderme interne prélevé sur une écaille d’oignon.

[   laisser agir 2 minutes le colorant, puis. rincer soigneusement plusieurs fois l’échantillon en utilisant le 2ème verre de montre (récupérer les liquides de rinçage dans un bécher).

[   monter entre lame et lamelle le fragment et l’observer au fort grossissement du microscope.

2 :  Site SVT : comparaison des molécules d’ADN et d’ARNm 

3 :  & Bordas (aide) : cellules colorées au Feulgen (coloration de l’ADN) => document 1 page 44 

4 :  & Bordas : une expérience qui révèle une propriété de l’ARN (document 4 page 45)

5 :  Site SVT : électronographie d’une cellule fracturée

6 :  & Bordas : une expérience de synthèse in vitro (document 6 page 45) ; information complémentaire : l’ADN est une molécule très stable ; elle a été ainsi retrouvée dans de nombreux fossiles, contrairement à l’ARNm.

7 :  Document fourni : Séquences des acides nucléiques de la b globine (brins 1 et 2 de l’ADN et brin de l’ARNm correspondant (d’après le logiciel Anagène)

8 :  Logiciel de simulation : « ADN/ARN » (P. Cosantino) : 3 premiers modules

9 :  Site SVT :  le mécanisme de la transcription.

10 : Site SVT : l’ARN polymérase, enzyme permettant la synthèse d’ARNm à partir d’ADN  (= transcription).

 

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